A Pro Evolution Soccer 6 (más néven Winning Eleven: Pro Evolution Soccer 2007 Észak-Amerikában) 2006-ban jelent meg Xbox 360 platformra, és a japán Konami fejlesztette és adta ki. Ez volt az első PES-játék, amely Xbox 360-ra is elérhetővé vált, és ezzel új korszakot nyitott a sorozat történetében.
A játék egyik legnagyobb erőssége a kifinomult játékmenet, amely a valósághű labdafizikával és a teljesen analóg kézi passzolási lehetőséggel emelkedik ki a korábbi verziók közül. A mozgásanimációk és a grafikai megjelenítés jelentős fejlődésen mentek keresztül, így a játékosok mozdulatai és a pályán zajló események sokkal élethűbbek lettek, mint a PlayStation 2-es változatban.
Bár a történetmesélés nem volt központi eleme a játéknak, a Master League mód lehetőséget adott arra, hogy a játékos saját csapatát építse fel és vezesse győzelemre, ami egyfajta karrierélményt nyújtott. Érdekességként említhető, hogy a játékban elérhető volt a PES Shop, ahol különleges kosztümöket – például pingvin- vagy raptorjelmezeket – lehetett vásárolni, amelyek nemcsak szórakoztatóak voltak, hanem egyedi játékmeneti élményt is kínáltak.
Habár az Xbox 360 verzióból kimaradt néhány funkció, mint például az International Challenge Mode és a részletes szerkesztési lehetőségek, cserébe a platformra optimalizált online közösség és a fejlettebb fizikai motor tette igazán különlegessé ezt a kiadást. A játék pozitív fogadtatásban részesült, és sok rajongó szerint ez volt az utolsó klasszikus PES, mielőtt a sorozat jelentősebb átalakuláson ment volna keresztül.